正常尿液的颜色可因饮水、出汗及活动量不同而深浅变化不等，一般从淡黄色至深琥珀色。当人体代谢异常或患某种疾患时，尿液的颜色会出现特殊改变。如在小便时发现尿液出现明显异常颜色，这可能表示泌尿系统有问题发生，可参考下面的提示。
深黄色尿
出汗或吐泻太过、过多进食某些食物或药物（如胡萝卜、B族维生素、核黄素、痢特灵、利福平等），可出现尿液变黄的情况，一旦停止服用，随即消失。若小便黄得像浓茶，则要注意黄疸的可能，医院就诊。
红色尿
用肉眼就能看到尿呈红色称为肉眼血尿，尿内含有大量的红血球。如尿液外观无大改变，只有在显微镜下才可见的血尿称为镜下血尿。引起血尿的原因很多，常见于泌尿生殖系统炎症、结石及肿瘤等，如各型肾炎、肾结核、急性膀胱炎、尿道炎及肾结石等。全身性疾病如白血病、猩红热、充血性心力衰竭等也常引起血尿。女性患者在月经期留尿验，易将阴道内经血混入尿液内，造成假性“血尿”，故月经期间留尿化验是不可取的。此外有些药物也可以引起红色尿，如氨基比林、苯妥英钠、利福平、酚红等。
白色尿或混浊样尿
某些特殊蔬菜和食物含有较多磷酸盐或碳酸盐时，特别在寒冷天气中，尿液可呈现白色混浊或有沉淀现象出现，经过加热和加酸后浑浊及沉淀消失则无大问题。但脓尿和菌尿时因尿内含有大量脓细胞或细菌等炎性渗出物，新鲜尿液即成浑浊样或白色云雾样，加热加酸其浑浊均不消失，此类尿多见于泌尿道化脓感染、肾盂肾炎、膀胱炎等。
乳白色尿
又称乳糜尿，尿液如同牛奶一样呈乳白色。这是由于肠道不能吸收糜液，造成乳糜返流进入尿中所致。引起乳糜尿有先天性因素，如先天淋巴管瓣膜功能异常；也有继发性因素，如常见的丝虫病及泌尿系统化脓性感染。
蓝绿色尿液
多见于服用美蓝、消炎痛、氨苯喋啶等药物后。